Başağrısı yakınması olan bir çocuğun öncelikle hekim tarafından klinik olarak değerlendirilmesi (öykü alınması, sistemik ve nörolojik muayene yapılması) gereklidir. Her hasta için mutlaka tetkik yapılması şart değildir. Öykü ve muayene sonucunda hekim beyin tomografisi, beyin manyetik rezonans görüntüleme, elektroensefalografi gibi testlerin yapılmasına gerek duyabilir. Küçük yaşlardaki çocuklara (genelde önerilen altı yaş altı) beyin görüntüleme yöntemi yapılması şarttır. Ayrıca bazı hastalarda kan tetkikleri, göz ve diş hekimi muayenesi gerekebilir.